NEUROimaging Processing & Analysis INfrastrucTure

Binnen Amsterdam UMC wordt veel MRI neuroimaging onderzoek gedaan, zowel aan de afdelingen Radiologie en Nucleaire Geneeskunde (RNG), Anatomie en Neurowetenschappen, als Neurologie (met name het MS centrum, Alzheimer centrum, CCA en Stroke Centrum), Neurochirurgie en Psychiatrie. Neuroimaging is een onderzoeksgebied waarin door snelle technologische ontwikkelingen steeds grotere en complexere datasets worden opgeslagen en geanalyseerd voor de ontwikkeling van biomarkers voor stratificatie en monitoring van veelvoorkomende ziekten zoals multiple sclerose, hersentumoren, dementie, herseninfarcten, en psychiatrische aandoeningen te verbeteren.
Momenteel worden deze beelden nog via arbeidsintensieve handmatige procedures geanalyseerd, meestal door individuele PhD studenten met tijdelijke contracten, waardoor veel tijd verloren gaat en het later lastig is te achterhalen welke data en verwerkingsstappen zijn gebruikt; data provenance (=herkomst) is niet geborgd. De technische infrastructuur, kennis en budgetten zijn dus in de huidige situatie versnipperd over individuele afdelingen en mensen en daardoor inefficiënt ingericht voor de groeiende behoefte, met nadelige gevolgen voor verantwoord data stewardship. Hierdoor is het neuroimaging onderzoek inefficiënt, wat leidt tot verlies van tijd, hogere kosten, en lagere kwaliteit en reproduceerbaarheid. Uit een enquête onder de neuroimaging research community is naar voren gekomen dat gebruikers grote behoefte hebben aan betere voorzieningen voor duurzame opslag en geautomatiseerde beeldverwerking.