Aetiologies of non-malaria febrile episodes in children under 5 years in sub-Saharan Africa

ObjectivesTo provide an overview of the most frequent aetiologies found in febrile episodes of children under 5 years from sub-Saharan Africa. MethodsMEDLINE and EMBASE were searched for publications in English and French on non-malaria fever episodes in African children under 5 years of age, which were published between January 1990 and July 2015. Case reports and conference abstracts were excluded. ResultsIn total, 3851 titles and abstracts were reviewed, and 153 were selected for full screening of which 18 were included in the present review. Bloodstream infection (BSI) was most commonly investigated (nine of 18) followed by urinary tract infection (UTI) (four of 18) and respiratory tract infection (RTI) (two of 18). Few studies investigated BSI and UTI in the same children (two of 18), or BSI and gastrointestinal infection (GII) (one of 18). As for BSI, the most frequently isolated bacteria were E. coli (four of 12), Streptococcus pneumonia (four of 12), Salmonella spp (three of 12) and Staphylococcus aureus (two of 12) with a positive identification rate of 19.7-33.3%, 5.2-27.6%, 11.7-65.4% and 23.5-42.0%, respectively. As for UTI, the main bacteria isolated were E. coli (six of six) and Klebsiella spp (six of six) with a positive rate of 20.0-72.3% and 10.0-28.5%, respectively. No bacterium was isolated in RTI group, but Human influenzae A and B were frequently found, with the highest positive identification rate in Tanzania (75.3%). Dengue virus (two of 12) was the most frequently reported viral infection with a positive identification rate of 16.7-30.8%. Finally, only rotavirus/adenovirus (69.2% positive identification rate) was found in GII and no bacterium was isolated in this group. ConclusionsThe high prevalence of treatable causes of non-malaria fever episodes requires a proper diagnosis of the origin of fever followed by an appropriate treatment, thereby reducing the under-5 mortality in sub-Saharan Africa and preventing the overprescription of antibiotics and thus circumventing the rise of antibiotic resistance. ObjectifsFournir un apercu des etiologies les plus frequemment trouvees dans les episodes febriles chez les enfants de moins de 5 ans en Afrique subsaharienne. MethodesMedline et Embase ont ete recherchees pour les publications en anglais et en francais sur les episodes de fievre non paludique chez les enfants africains de moins de 5 ans, qui ont ete publiees entre janvier 1990 et juillet 2015. Les rapports de cas et les resumes de conferences ont ete exclus. ResultatsAu total, 3851 titres et resumes ont ete examines, et 153 ont ete selectionnes pour le l'analyse complete, dont 18 ont ete inclus dans la presente etude. L'infection sanguine (IS) a ete la plus souvent investiguee (9/18), suivie par l'infection des voies urinaires (IVU) (4/18) et l'infection des voies respiratoires (IVR) (2/18). Peu d'etudes ont ivestigue l'IS et l'IVU chez les memes enfants (2/18), ou L'IS et l'infection gastrointestinale (IGI) (1/18). En ce qui concerne l'IS, les bacteries les plus frequemment isolees etaient E. coli (12/04), Streptococcus pneumonia (12/04), Salmonella spp (12/03) et Staphylococcus aureus (12/02) avec un taux d'identification positive de 19,7 a 33,3%, de 5,2 a 27,6%, de 11,7 a 65,4% et de 23,5 a 42,0%, respectivement. Quant aux IVU, les principales bacteries isolees etaient E. coli (6/6) et Klepsiella spp (6/6) avec un taux d'identification positive de 20,0 a 72,3% et de 10,0 a 28,5%, respectivement. Aucune bacterie n'a ete isolee dans le groupe IVR, mais influenzae A et B humains ont ete frequemment retrouves, avec le taux d'identification positive le plus eleve en Tanzanie (75,3%). Le virus de la dengue (2/12) etait l'infection virale la plus frequemment rapportee avec un taux d'identification positive de 16,7 a 30,8%. Enfin, seuls les rotavirus/adenovirus (69,2% de taux d'identification positive) ont ete retrouves dans les IGI et aucune bacterie n'a ete isolee dans ce groupe. ConclusionsLa prevalence elevee de causes traitables d'episodes de fievre non-paludique exige un bon diagnostic de l'origine de la fievre, suivi d'un traitement approprie, afin de reduire la mortalite des moins de 5 ans en Afrique subsaharienne et d'empecher la prescription excessive d'antibiotiques, evitant ainsi l'augmentation de la resistance aux antibiotiques. ObjetivosProveer una vision general de las etiologias mas frecuentemente encontradas en episodios febriles de ninos menores de 5 anos en africa subsahariana. MetodosSe realizaron busquedas en Medline y Embase, de publicaciones en Ingles y Frances, sobre episodios de fiebre no malarica en ninos Africanos menores de 5 anos, que hubiesen sido publicados entre Enero de 1990 y Julio del 2015. Se excluyeron informes de casos y resumenes de conferencias. ResultadosEn total se revisaron 3851 titulos y resumenes. Se seleccionaron 153 para una revision completa, y de estos se han incluido 18 en la revision. La sepsis (IS) era la infeccion mas comun (9/18), seguida por la infeccion del tracto urinario (ITU) (4/18) y la infeccion del tracto respiratorio (ITR) (2/18). Pocos estudios investigaban IS e ITU en los mismos ninos (2/18), o IS e infeccion gastrointestinal (IGI) (1/18). En lo que a la IS se refiere, la bacterias mas frecuentemente aislada eran E. coli (4/12), Streptococcus pneumonia (4/12), Salmonella spp (3/12) y Staphylococcus aureus (2/12) con una tasa de identificacion positiva del 19.7-33.3%, 5.2-27.6%, 11.7-65.4% y 23.5-42.0%, respectivamente. En cuanto a la ITU, las principales bacterias aisladas eran E. coli (6/6) y Klebsiella spp (6/6), con una tasa positiva de 20.0-72.3% y 10.0-28.5% respectivamente. No se aislo ninguna bacteria en el grupo ITR, pero se hallaban a menudo los virus influenzae humana A y B, con la tasa de identificacion positiva mas alta en Tanzania (75.3%). El virus del dengue (2/12) era la infeccion viral mas frecuentemente reportada, con una tasa de identificacion positiva del 16.7-30.8%. Finalmente, solo se encontro rotavirus/adenovirus (tasa de identificacion positiva del 69.2%) en IGI y no se aislo ninguna bacteria en este grupo. ConclusionesLa alta prevalencia de causas tratables de fiebre no-malarica requiere de un buen diagnostico del origen de la fiebre, seguido por un tratamiento apropiado, reduciendo asi la mortalidad en menores de 5 anos en africa subsahariana y la prevencion de la prescripcion excesiva de antibioticos, evitando el aumento de la resistencia a los mismos